1957年，一度病危。

1961年1月4日，因患肺结核病逝于维也纳，死后被埋在了阿尔卑包赫村，他的墓碑上刻着以他命名的薛定谔方程。

1913年，与R.W.F.科尔劳施合写了关于大气中镭 A（即Po）含量测定的实验物理论文，为此获得了奥地利帝国科学院的海廷格奖金。

1926年，在阿尔伯特·爱因斯坦（Albert Einstein）关于单原子理想气体的量子理论和路易·维克多·德布罗意（Louis Victor·Duc de Broglie）的物质波假说的启发下，从经典力学和几何光学间的类比，提出了对应于波动光学的波动力学方程，后称薛定谔方程，奠定了波动力学的基础。1926年1—6月，一连发表了四篇论文，题目都是《量子化就是本征值问题》，系统地阐明了波动力学理论，并证明了波动力学与海森伯矩阵力学在数学上是等价的。

埃尔温·薛定谔提出薛定谔猫思想实验，试图证明量子力学在宏观条件下的不完备性。其大意是：在一个封闭的盒子里装有一只猫和一个与放射性物质相连的释放装置。在一段时间之后，放射性物质有可能发生原子衰变，通过继电器触发释放装置，放出毒气，也有可能不发生衰变，因此依据常识，这只猫或是死的，或是活的。而依据量子力学中通用的解释，波包塌缩依赖于观察，在观察之前，这只猫应处于不死不活的叠加态，这显然有悖于人们的常识，从而凸显出这种解释的困境。为摆脱这种困境，人们设想出了种种方案，但似乎并不能填平这种常识与微观特异性之间的鸿沟。例如格利宾本人所赞成的多世界解释，认为猫死与猫活这两种结果分属两个独立平行且真实存在的世界，是我们的观察行为选择了其中之一为我们的世界。这似乎不仅没有消除，反倒是增加了人们的困惑。

埃尔温·薛定谔发表了50余本著作涉及到不同的题目，主要著作有《波动力学四讲》《统计热力学》《生命是什么——活细胞的物理面貌》等。

1944年 ，薛定谔出版了《生命是什么》一书，提出了负熵（Negentropie）的概念，试图用热力学、量子力学和化学理论来解释生命的本性。该书使许多青年物理学家开始注意生命科学中提出的问题，引导人们用物理学、化学方法去研究生命的本性，使薛定谔成为分子生物学的先驱。

埃尔温·薛定谔的母亲血统是一半奥地利和一半英国，他的父母二人都在家讲这两种语言，他小时候同时学习英语和德语，他的父亲是一位天主教的信徒，而母亲是一位路德教派的信徒。在幼年时期，他深受叔本华的影响，因此，他广泛阅读叔本华的作品，他的一生对色彩理论、哲学、东方宗教深感兴趣，特别是印度教。

埃尔温·薛定谔毕生陷于恋情的漩涡与纠葛中。不计青少年时期的情窦初开和数次情感遭遇，即使在33岁那年成婚后，他仍然是激情充溢，外遇不断，其对象既有已婚的研究助手的妻子，也有年方二八的他曾辅导过数学的女中学生，既有闻名遐迩的演员和艺术家，也有年轻的政府职员，而这种浪漫风流一直持续到年逾花甲，并且有不止一个非婚生的孩子。对于每一段情感履历，他都非常投入，并为此创作了不少缠绵的情诗。但奇怪的是，生活在维也纳和都柏林这样宗教色彩很浓的地方，他竟然能全然不顾忌传统礼数，认为这是他个人的自由，甚至设想过一妻一妾的生活；而同样令人称奇的是，他与其原配安妮的婚姻历经这种种事端，竟然能白头到老，而且安妮还亲自照料了他非婚生孩子的婴儿期。或许这与安妮自己没有孩子不无关系，但即便如此，这种薛定谔式的爱情，这样的家庭关系，与我们头脑中的科学家形象，恐怕还是会有很大反差，相去甚远的。

埃尔温·薛定谔发展了分子生物学，是量子力学奠基人之一。

2001年11月，剧作家matthew wells的新作《薛定谔的女朋友》（schrodinger’s girfriend）在旧金山的fort mason center首演。